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Achtung Änderungen!
- Das Hauptseminar "Biomedizinische Datenanalyse" und das Seminar "Visual Analytics" wurden zusammengelegt
- Der Seminartermin wurde auf dienstags 14:00-15:30 Uhr verlegt.
Dozent
Termine
- Dienstags 14:00-15:30 Uhr (0.447)
- Erster Termin: Dienstag, 27.4.2010
Aktuelles
- Vorbesprechung:
Mittwoch 31.3.2010, 14:00-15:00Uhr, Raum 1.168
Beschreibung - Medizinische Datenanalyse (HS)
Im Bereich der medizinischen Forschung sind in den letzten Jahren die Datenmengen und die Komplexität der Fragestellungen kontinuierlich gestiegen.
Microarrays, bildgebende Verfahren, aber auch umfangreiche Patientendatenbanken mit Langzeit Follow-Up eröffnen Möglichkeiten,
die vor einigen Jahren noch undenkbar gewesen wären.
Mit den Daten wachsen nun auch die Anforderungen an die Informatik und deren Methoden.
Im Rahmen dieses Hauptseminars werden einige der aktuellen Methoden und Verfahren im Rahmen der Biomedizinischen Datenanalyse vorgestellt und diskutiert.
Dabei soll anhand beschriebener praktischer Anwendungsfälle der spezielle Nutzen dargestellt und die mit den Vorgehensweisen verbundenen Probleme verdeutlicht werden.
Beispiele hierfür sind: Visualisierung Medizinischer Datenmengen, Mustererkennung bei Patientendaten, Vorhersagen von Krankheitsverläufen und Überlebenszeiten, etc.
Die Vortragstheme entsprechen dem gegenwärtigen Stand der Forschung oder besonderen praktischen Anwendungen.
Als Einstieg zu jedem Thema wird Literatur zur Verfügung gestellt auf denen aufbauend dann das Themengebiet erarbeitet wird.
Beschreibung - Visual Analytics (S)
Die visuelle Analyse (Visual Analytics) wir insbesondere dort eingesetzt, wo
es gilt, komplexe Datenzusammenhänge aufzuspüren und zu verstehen. Dazu wird
im Gegensatz zu vollautomatischen Verfahren, die menschliche Fähigkeit
zur Mustererkennung ausgenutzt. Um dennoch komplexe und grosse Datenmengen
verarbeiten zu können, werden die Daten maschinell aufbereitet und durch ihre
Merkmale abstrahiert. In einem solchen Analyseprozess spielt die Schnittstelle
zwischen Mensch und Computer offensichtlich eine wichtige Rolle. Für eine
effiziente Analyse sind deshalb auch effiziente Visualisierungen der Daten
sowie eine intuitive Interaktion mit ihnen erforderlich. Diese drei Pfeiler -
Vorverarbeitung, Visualisierung und Interaktion - werden in diesem Seminar
näher beleuchtet.
Im Rahmen des Seminars werden verschiedene aktuelle Visual Analytics Verfahren
für unterschiedliche Datendomänen (z.B.
Videodatenbanken,Textsammlungen,Trajektorien,Social Networks, etc.) vorgestellt.
Dabei wird insbesondere auf folgende Fragen eingegangen: Visualisierung von
Daten, Interaktion mit den Daten und ihrer Visualisierung, Skalierbarbeit
bezüglich des Datenumfangs, automatische Aufbereitung von Informationen
mittels Merkmalsextraktion, Unsicherheiten in Daten und ihr Einfluss auf den Prozess
der Entscheidungsfindung.
Ablauf
Jede(r) Seminarteilnehmer(in) hält zu einem Thema einen Vortrag mit anschließender Diskussion.
Spätestens eine Woche vor dem Vortrag müssen die Vortragsfolien elektronisch abgegeben werden
(Powerpoint oder PDF-Datei), spätestens zwei Wochen vor dem Vortrag findet eine Vorbesprechung mit
den Betreuern statt und die Ausarbeitung muss abgegeben werden.
Bis zwei Wochen vor dem Vortragstermin gibt die/der Vortragende eine schriftliche Zusammenfassung in elektronischer Form (Postscript oder PDF-Datei) ab.
Voraussetzungen
Vordiplom.
Sonsiges
Vorlagen und Materialen zum Seminar
Literatur
- P. Haas: Medizinische Informationssysteme und elektronische Krankenakten, Springer 2004
- J. Han, M. Kamber: Data Mining. Concepts and Techniques, Morgan Kaufmann, 2006
- T. Hastie, R. Tibshirani, Jerome Friedman: The Elements of Statistical Learning, Springer, 2001
- J.J. Thomas, K.A. Cook: Illuminating the path: The research and development agenda for visual analytics, IEEE Computer Society, 2005, online available.
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